Virgen de la Merced en PanamáDespués de Santo Domingo, los mercedarios fundaron en Panamá el primer monasterio en Tierra Firme el año 1522, que será el punto de partida de la expansión española hacia América del Sur.

En 1671 la ciudad es atacada por las fuerzas del pirata inglés Henry Margan con intenciones de saquearla y agregarla al dominio inglés. El capitán general de Tierra Firme, Juan Pérez de Guzmán ordena evacuar la ciudad y volar los depósitos de pólvora provocando un gigantesco incendio que la destruyó totalmente. Las ruinas de la antigua ciudad todavía se mantienen, incluyendo la torre de su catedral. La ciudad de Panamá fue reconstruida en 1673 en una nueva localización a 2 km al oeste-suroeste de la ciudad original a las faldas del cerro Ancón.

La devoción a la Virgen de la Merced se acrecentó tras la invasión del pirata Margan y el papel que jugaron los mercedarios en el rescate de la población.